Saint-Frajou est situé dans le Comminges à 35 km au Nord-est de Saint-Gaudens et à 7 km de l'Isle-en-Dodon.
Le musée de peinture de Saint-Frajou est à l'emplacement de l'ancienne école communale, au centre du village, tout proche de la place principale et de la mairie.

Saint Frajou, petit village de 200 habitants, fait partie du canton de L'Isle en Dodon, en Haute Garonne. Le village tient son nom de Saint Fragulphe, martyr des Sarrasins au huitième siècle. Il combattit contre les envahisseurs et fut décapité. D'après la légende la tête de Fragulphe a roulé jusqu'à une pierre où trois gouttes de sang restent ineffaçables. De cet endroit jaillit aussitôt une fontaine.
La fontaine existe toujours et accueille de nombreux visiteurs.
Saint-Frajou est la plus petite commune de France possédant un musée de peinture.